El tratamiento farmacológico se registra mediante una tabla de fármacos que se puede configurar directamente desde la página de la Agencia Española del Medicamento
https://sinaem4.agemed.es/consaem/fichasTecnicas.do?metodo=detalleForm
La configuración de tratamientos se almacena en la tabla FARMACOS.
Los fármacos se organizan según grupos terapéuticos, y pueden a su vez subclasificarse en subgrupos.
Existe una opción de búsqueda de fármacos que nos permite seleccionar los que corresponden a un grupo terapéutico y/o contienen un principio activo, así como aquellos que contengan un texto determinado en el nombre:
Tratamiento Antirretroviral
Cuando se indica para un paciente un fármaco antirretroviral por defecto aparecerá marcada la casilla Incluir en línea de principios activos antirretrovirales.
Si se deja marcada la casilla de incluir en línea de principios activos antirretrovirales los datos del nuevo fármaco antirretroviral registrado se tendrán en cuenta para actualizar de forma automática la relación de escalones de tratamiento antirretroviral (tabla TTO_VIH):
El tratamiento antirretroviral se puede indicar tanto desde la solapa Fármacos, donde aparecen todos los tratamientos, como desde la solapa VIH > Tratamiento antirretroviral, donde sólo se presentan los fármacos antirretrovirales.
El botón 
nos permite finalizar el escalón TAR actual colocando la misma fecha de finalización para todos los antirretrovirales que estuvieran sin fecha de finalización en ese momento para el paciente.
Tratamiento para VHC
Este tipo de tratamiento tiene dos campos específicos: RVS y RVF.
Se pueden registrar tanto desde la solapa general de Fármacos como desde la solapa VHC.